Es el puente entre la empresa proveedora de la tarjeta de débito o crédito y la Web de la empresa vendedora, su función es similar a los pagos realizados con tarjeta de crédito en una tienda física, en este caso la pasarela de pago es un Terminal Punto de Venta virtual.

El cliente realiza una operación de comercio electrónico, puede ser a través de una tienda virtual, en la que selecciona los productos a comprar y se calcula el importe a pagar, cuando el cliente decide pagar la Web del proveedor se redirecciona a la Web de la pasarela de pago (MoneyBookers, 2checout, Paypal, otros). La Web de la de la pasarela de pagos solicita el número de tarjeta, el código de seguridad de la tarjeta y la fecha de vencimiento de la tarjeta de débito o crédito, esos datos son enviados al gateway del proveedor de la tarjeta de débito o crédito para validar la tarjeta y verificar que existencia de fondos; si la respuesta es positiva, el proveedor de la tarjeta de crédito hace un movimiento internamente de cuenta a cuenta (proveedor de la tarjeta a pasarela de pago) e informa el resultado de la operación.

Dependiendo de la pasarela de pago que se haya escogido, se emite un cheque a la empresa vendedora o de frente los deposita a su cuenta de banco descontando previamente el descuento de la comisión por la transacción.

Los datos del cliente solicitados por la pasarela de pago viajan encriptados hacia los servidores de la empresa proveedora de la tarjeta, de tal manera que ni la empresa vendedora nunca llega a saber cual es el número de la tarjeta del cliente ni tampoco la puede guardar para cobros posteriores. Los pagos se hacen en el servidor de la empresa proveedora de la tarjeta, la aplicación de la pasarela de pago solo avisa al proveedor de la tarjeta la cantidad a cobrar.

La pasarela de pago es seguridad para los clientes, quienes pueden comprar desde cualquier parte del mundo, sin emabrgo también se debe considerar las comisiones que cobran las pasarelas de pago por la transacción ya que es mayor a las comisianes de pagos hechos en tiendas físicas.